Bacteremia by non-O1/non-O139 Vibrio cholerae: Case description and literature review / Bacteriemia por Vibrio cholerae no-O1/no-O139: descripción de un caso y revisión de la literatura

Bacteremia by non-O1/non-O139 Vibrio cholerae is a rare entity associated with high mortality rates. We report a case of non-O1/non-O139 V. cholerae bacteremia confirmed by polymerase chain reaction and agglutination tests. The clinicoepidemiological characteristics and therapeutic options for this infection are also described.

La bacteriemia por Vibrio cholerae no-O1/no-O139 es una entidad poco frecuente que se asocia con altas tasas de mortalidad. Se reporta un caso de bacteriemia por V. cholerae no-O1/no-O139 confirmado por reacción en cadena de la polimerasa y test de aglutinación. Se describen las características clinicoepidemiológicas y las opciones terapéuticas para esta infección.

Actividad de fosfolipasas y proteasas en aislamientos de especies de Candida colonizadoras y causantes de vulvovaginitis en mujeres gestantes / Phospholipase and proteinase activities of isolatesof colonizing Candida spp. causing vulvovaginitis in pregnant women

Introducción. Las proteasas y las fosfolipasas son factores de virulencia de Candida spp. que cumplen un papel importante en la invasión de los tejidos. Entre los factores relacionados con el huésped, se encuentran algunos asociados con las características ambientales y otros con la colonización. Objetivo. Determinar la actividad de fosfolipasas y proteasas en aislamientos de especies colonizadoras y patógenas de Candida spp., aisladas de mujeres gestantes de Cartagena de Indias. Materiales y métodos. Se determinó la actividad de fosfolipasas y proteasas en 56 aislamientos mediante degradación del sustrato y cálculo del coeficiente de actividad enzimática. Se compararon las actividades de fosfolipasas y proteasas, entre los aislamientos colonizadores y los patógenos. Resultados. La actividad de la fosfolipasa fue "muy alta" (< 0,69) en 34 aislamientos e, igualmente, la de la proteasa en 14. No hubo diferencias significativas al comparar las actividades de las fosfolipasas y de las de las proteasas, entre los aislamientos colonizadores y los patógenos. Conclusiones. La actividad de las fosfolipasas predominó como factor de virulencia en los aislamientos estudiados. No obstante, no se encontró una diferencia significativa entre los grupos de aislamientos colonizadores y los patógenos, en cuanto a las actividades de fosfolipasas y proteasas.

Introduction. Proteases and phospholipases are virulence factors of Candida spp. that play an important role in tissue invasion. Among the factors related to the host some are associated with environmental characteristics and others with Candida colonization. Objectives. To determine phospholipase and protease activities in colonizing and pathogenic strains, isolated from pregnant women in Cartagena de Indias. Materials and methods. Phospholipase and protease activity was determined in 56 isolates, evaluating substrate degradation and calculating the enzyme activity coefficient. Phospholipase and protease activities were compared between colonizing and pathogenic strains. Results. "Very high" (<0.69) phospholipase and protease activity was found in 34 and 14 isolates, respectively. There was no significant difference when comparing phospholipase and protease activities between colonizing and pathogenic isolates. Conclusions. Phospholipase activity predominated as a virulence factor in the studied strains, but no significant difference was found between colonizing and pathogenic strains for phospholipase and protease activities.

Genotipos de virulencia de Helicobacter pylori y su asociación con lesiones precursoras de malignidad gástrica y parámetros histológicos en pacientes colombianos / Helicobacter pylori virulence genotypes and their relationship with precursor lesions of gastric malignancy and histological parameters in infected patients in Colombia

Se determinó la presencia de los genotipos de virulencia de Helicobacter pylori y su asociación con las lesiones precursoras de malignidad gástrica y parámetros histológicos en pacientes con síntomas de dispepsia del suroccidente de Colombia. Se realizó reacción en cadena de polimerasa (PCR) para la caracterización genética de vacA, cagA, babA2 y sabA. Se empleó la prueba de chi cuadrado o Fischer para evaluar la asociación de cada genotipo sobre el desenlace clínico. En los pacientes con lesiones precursoras de malignidad gástrica se encontró que el 86,3% presentaron el genotipo vacA s1/m1, el 68,1% cagA+ y los genotipos babA2+ y sabA+ con el 68,8% y 55,8%, respectivamente. También, se demostró la asociación entre los genotipos de virulencia y el grado severo de infiltración de células polimorfonucleares. Además, se encontró una asociación entre la combinación de los genes vacA/cagA, vacA/sabA y babA2/sabA. Este estudio proporciona evidencia acerca de la asociación de los genotipos de virulencia del H. pylori y la inflamación gástrica en pacientes infectados.

The aim of this research was to determine the presence of Helicobacter pylori virulence genotypes and their association with precursor lesions of gastric malignancy and histological parameters in patients with dyspepsia symptoms in southwestern Colombia. Polymerase chain reaction (PCR) was used for the genetic characterization of vacA, cagA, babA2 and sabA. The chi-square or Fischer test were used to evaluate the association between each genotype and the clinical outcome. We found that 86.3% of the patients with precursor lesions of gastric malignancy presented the vacA s1/m1 genotype, 68.1% had the cagA+ genotype and 68.8% and 55.8% had the babA2+ and sabA+ genotypes, respectively. Our results show association between virulence genotypes and severe degree of polymorphonuclear cell infiltration. In addition, we found an association between the combination of vacA/cagA, vacA/sabA and babA2/sabA genes. This study provides evidence about the association of H. pylori virulence genotypes and gastric inflammation in infected patients.

Detection and expression of SapS, a class C nonspecific acid phosphatase with O-phospho-L- tyrosine-phosphatase activity, in Staphylococcus aureus isolates from patients with chronic osteomyelitis / Detección y expresión de SapS, una fosfatasa ácida no específica de clase C con actividad de fosfatasa O-fosfotirosina, en aislamientos de Staphylococcus aureus de pacientes con osteomielitis crónica

Introduction. The identity of Staphylococcus aureus virulence factors involved in chronic osteomyelitis remains unresolved. SapS is a class C non-specific acid phosphatase and a well-known virulence factor that has been identified in S. aureus strain 154 but in protein extracts from rotting vegetables. Objective. To identify the SapS gene and characterize the activity of SapS from S. aureus strains: 12 isolates from bone infected samples of patients treated for chronic osteomyelitis and 49 from a database with in silico analysis of complete bacterial genomes. Materials and methods. The SapS gene was isolated and sequenced from 12 S. aureus clinical isolates and two reference strains; 49 S. aureus strains and 11 coagulase-negative staphylococci were tested using in silico PCR. Culture media semi-purified protein extracts from the clinical strains were assayed for phosphatase activity with p-nitro-phenyl- phosphate, O-phospho-L-tyrosine, O-phospho-L-serine, and OphosphoL-threonine in conjunction with various phosphatase inhibitors. Results. SapS was detected in the clinical and in-silico S. aureus strains, but not in the in silico coagulase-negative staphylococci strains. Sec-type I lipoprotein-type N-terminal signal peptide sequences; secreted proteins, and aspartate bipartite catalytic domains coding sequences were found in the SapS nucleotide and amino acid sequence analysis. SapS dephosphorylated with p-nitro-phenyl-phosphate and ophosphoLtyrosine were selectively resistant to tartrate and fluoride, but sensitive to vanadate and molybdate. Conclusion. SapS gene was found in the genome of the clinical isolates and the in silico S. aureus strains. SapS shares biochemical similarities with known virulent bacterial, such as protein tyrosine phosphatases, suggesting it may be a virulence factor in chronic osteomyelitis.

Introducción. Se desconoce la identidad de los factores de virulencia de Staphylococcus aureus implicados en la osteomielitis crónica. Sin embargo, SapS, una fosfatasa ácida no específica de clase C, es un factor de virulencia reconocido y ya fue identificada en la cepa 154 de S. aureus, pero en extractos proteicos de vegetales podridos. Objetivo. Detectar el gen SapS y caracterizar la actividad de la fosfatasa SapS en cepas de S. aureus aisladas de pacientes con osteomielitis crónica y en las reportadas en una base de datos de análisis in silico de genomas bacterianos completos. Materiales y métodos. Se aisló y secuenció el gen SapS en los 12 aislamientos clínicos de S. aureus y en dos cepas de referencia; estas secuencias se analizaron junto con las secuencias de las cepas reportadas en la base de datos de genomas bacterianos: 49 cepas de S. aureus y 11 cepas de estafilococos negativos para coagulasa. Se evalúo la actividad de la fosfatasa SapS, presente en los extractos de los sobrenadantes de los cultivos de las cepas clínicas, mediante la hidrólisis de fosfato p-nitrofenil, O-fosfo-L- tirosina, O-fosfo-L serina y O-fosfo-L treonina junto con varios inhibidores de fosfatasas. Resultados. Se detectó el gen SapS en el genoma de las cepas clínicas y en las 49 cepas de S. aureus analizadas in silico, pero no en las 11 cepas de estafilococos negativos para coagulasa. La secuenciación de SapS reveló un péptido señal presente en el extremo N-terminal de proteínas extracelulares y los dominios bipartitos de aspartato (DDDD) en su sitio catalítico. SapS hidroliza selectivamente el fosfato p-nitrofenil y la O-fosfo-L-tirosina, pero es sensible a vanadato y molibdato. Conclusión. Se encontró SapS en el genoma de S. aureus de las cepas clínicas y de las cepas de simulación computacional. La SapS con actividad específica para la hidrólisis de la O-fosfo-L-tirosina comparte similitudes bioquímicas con las fosfatasas-tirosina bacterianas, por lo que puede formar parte de la red de factores de virulencia de la osteomielitis crónica.

Helicobacter pylori infection: A balance between bacteria and host / Helicobacter pylori: un balance entre bacterias y huésped

Abstract In Argentina, despite the important studies conducted on the prevalence of infection and the antibiotic resistance of Helicobacter pylori, there are no reports simultaneously analyzing a profile of virulence factors of the bacterium and polymorphisms in cytokine genes in patients with different alterations in the gastric mucosa (including intestinal metaplasia, IM). Our aim was to evaluate H. pylori genotypes in 132 adult patients with chronic gastritis presenting three different histological findings (inactive chronic gastritis, active chronic gastritis IM( and active chronic gastritis IM+) along with SNP-174 G>C in the IL-6 gene. cagA, vacA and babA2 genes were analyzed by multiplex PCR. The -174 G>C SNP IL-6 gene was analyzed by PCR-RFLP. Patients with active chronic gastritis IM+ showed the highest proportion of the cagA(+)/IL-6GG, cagA(+)/vacAm1s1/IL-6GG and cagA(+)/vacAm1s1/babA2(+)/IL-6GG combinations (p<0.05). There was 4-5 times greater probability of finding patients presenting the GG genotype for SNP-174 G>C IL-6, which in turn were infected with the most virulent H. pylori genotypes -cagA(+), cagA(+)/vacAm1s1 and cagA(+)/vacAm1s1/babA2- in the ACGIM+ group in comparison to the ICG group. Our results provide regional data to the idea that the transition towards severe alterations in the gastric mucosa would be the result of a balance between specific factors of H. pylori and inherent host factors. This fact can be useful to identify patients at greater risk and to select those individuals requiring appropriate eradication treatment to prevent progression to gastric cancer.

Resumen En Argentina, a pesar de los importantes estudios realizados sobre la prevalencia de infección y la resistencia a antibióticos de Helicobacter pylori, no existen reportes que analicen simultáneamente un perfil de factores de virulencia de la bacteria y polimorfismos en genes de citoquinas en pacientes con diferentes alteraciones en la mucosa gástrica (incluida la metaplasia intestinal [MI]). Nuestro objetivo fue evaluar genotipos de H. pylori en 132 pacientes adultos con gastritis crónica, con tres diferentes hallazgos histológicos (gastritis crónica inactiva [GCI], gastritis crónica activa [MI(] y gastritis crónica activa [MI+]), junto con el SNP-174 G>C en el gen de IL- 6. Los genes cagA, vacA y babA2 se analizaron mediante PCR multiplex. El SNP-174 G>C IL-6 se analizó mediante PCR-RFLP. Los pacientes con gastritis crónica activa MI+ mostraron la mayor proporción de combinaciones cagA(+)/IL-6GG, cagA(+)/vacAm1s1/IL-6GG y cagA(+)/vacAm1s1/babA2(+)/IL-6GG (p<0,05). Hubo 4-5 veces mayor probabilidad de encontrar pacientes con el genotipo GG en SNP-174 G>C IL-6 y a su vez infectados con los genotipos más virulentos de H. pylori-cagA(+), cagA(+)/vacAm1s1 y cagA(+)/vacAm1s1/babA2-en el grupo gastritis crónica activa MI+ en comparación con el grupo GCI. Nuestros resultados aportan datos regionales a la idea de que la transición hacia alteraciones más graves en la mucosa gástrica resultaría de un equilibrio entre factores específicos de H. pylori y factores inherentes al huésped. Esto puede ser útil para identificar pacientes con mayor riesgo y seleccionar aquellos individuos que requieran un apropiado tratamiento de erradicación para prevenir la progresión al cáncer gástrico.

Helicobacter pylori infection: A balance between bacteria and host.

In Argentina, despite the important studies conducted on the prevalence of infection and the antibiotic resistance of Helicobacter pylori, there are no reports simultaneously analyzing a profile of virulence factors of the bacterium and polymorphisms in cytokine genes in patients with different alterations in the gastric mucosa (including intestinal metaplasia, IM). Our aim was to evaluate H. pylori genotypes in 132 adult patients with chronic gastritis presenting three different histological findings (inactive chronic gastritis, active chronic gastritis IM- and active chronic gastritis IM+) along with SNP-174 G>C in the IL-6 gene. cagA, vacA and babA2 genes were analyzed by multiplex PCR. The -174 G>C SNP IL-6 gene was analyzed by PCR-RFLP. Patients with active chronic gastritis IM+ showed the highest proportion of the cagA(+)/IL-6GG, cagA(+)/vacAm1s1/IL-6GG and cagA(+)/vacAm1s1/babA2(+)/IL-6GG combinations (p<0.05). There was 4-5 times greater probability of finding patients presenting the GG genotype for SNP-174 G>C IL-6, which in turn were infected with the most virulent H. pylori genotypes -cagA(+), cagA(+)/vacAm1s1 and cagA(+)/vacAm1s1/babA2- in the ACGIM+ group in comparison to the ICG group. Our results provide regional data to the idea that the transition towards severe alterations in the gastric mucosa would be the result of a balance between specific factors of H. pylori and inherent host factors. This fact can be useful to identify patients at greater risk and to select those individuals requiring appropriate eradication treatment to prevent progression to gastric cancer.

Candida albicans the main opportunistic pathogenic fungus in humans.

Candida albicans is a commensal of the mammalian microbiome and the primary pathogenic fungus of humans. It becomes a severe health problem in immunocompromised patients and can cause a wide variety of mucosal and systemic infections. The interaction between C. albicans and host cells is characterized by the expression of virulence factors such as adhesins and invasins, the secretion of hydrolytic enzymes, a transition from yeast to filamentous hyphae form, and the ability to form biofilms; these features collectively result in cell adhesion, invasion, and damage. This review describes complex commensal interactions of C. albicans with host cells and the cellular events that it triggers in a pathogenic environment. We also review the host immune response induced by C. albicans antigens and the mechanisms developed by this fungus to avoid the action of antifungal agents.

ß-lactamasas de espectro extendido y factores de virulencia en Escherichia coli uropatógenas en asilos de ancianos en Lima, Perú / ß-lactamases and virulence factors in uropathogenic Escherichia coli in nursing homes in Lima, Peru

RESUMEN Los asilos de ancianos son instituciones con una alta prevalencia de infecciones del tracto urinario ocasionado por Escherichia coli productoras de ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE), con diversos factores de virulencia. El objetivo del estudio fue determinar la frecuencia del gen bla CTX-M y de ocho genes de virulencia en 35 E. coli uropatógenas productoras de BLEE provenientes de seis asilos en Perú, durante el 2018. El 57,1% (20/35) de las E. coli fueron portadores del gen bla CTX-M. Además, se obtuvo una frecuencia del 46% (15/35) y 37% (13/35) de hly-alfa y cnf-1, respectivamente; elevada presencia de los genes iucC (63%, 22/35), aer (94%, 33/35) y chuA (94%, 33/34) y una frecuencia del 46% (16/35) y del 91% (32/34) de los genes pap GII y nanA, respectivamente. Existe predominancia en la distribución del gen bla CTX-M, además de una alta frecuencia de exotoxinas que le confieren una ventaja competitiva para diseminarse hacia el torrente sanguíneo.

ABSTRACT Nursing homes are institutions with high prevalence of urinary tract infections caused by ESBL-producing E. coli with several virulence factors. The aim of this study was to determine the frequency of the bla CTX-M gene and eight virulence genes in 35 ESBL-producing uropathogenic E. coli from six nursing homes in Peru during 2018. Of the E. coli samples, 57.1% (20/35) were carriers of the bla CTX-M gene. Furthermore, we obtained frequencies of 46% (15/35) and 37% (13/35) for hly-alpha and cnf-1, respectively; we also found high presence of the iucC (63%, 22/35), aer (94%, 33/35) and chuA genes (94%, 33/34) as well as a frequency of 46% (16/35) and 91% (32/34) for the pap GII and nanA genes, respectively. The bla CTX-M gene is predominant and a high frequency of exotoxins gives it a competitive advantage for spreading into the bloodstream.

Helicobacter pylori: novedades, genes de virulencia y resistencia a los antibióticos en Colombia / Helicobacter pylori: novelties, virulence genes and antibiotic resistance in Colombia / Helicobacter pylori: novidades, genes de virulência e resistência aos antibióticos na Colômbia

Helicobacter pylori es un carcinógeno tipo I resistente a múltiples antibióticos y con alta prioridad en salud pública. La infección por este microorganismo está influenciada por una interacción compleja entre la genética del huésped, el entorno y múltiples factores de virulencia de la cepa infectante. Afecta al 50 % de la población mundial, provocando afecciones gastroduodenales graves, la mayoría de forma asintomática. El 20 % de los individuos con H. pylori pueden desarrollar a través del tiempo lesiones gástricas preneoplásicas y el 2 % de ellos un cáncer gástrico. Las manifestaciones clínicas gastrointestinales y extragastrointestinales están asociadas a su virulencia y a la respuesta del sistema inmunológico con la liberación de citosinas proinflamatorias, tales como TNF-alfa, IL-6, IL-10 e IL-8, causantes de inflamación aguda y crónica. Múltiples factores de virulencia han sido estudiados como el gen A asociado a la citotoxina (CagA) y la citotoxina vacuolante (VacA), los cuales juegan un rol importante en la aparición del cáncer gástrico. Dada la resistencia cada vez mayor a los antibióticos utilizados, las líneas de estudio en el futuro inmediato deben estar encaminadas en establecer la utilidad de los nuevos antibióticos y la determinación de profagos colombianos en todo el país. Esta revisión tiene como objetivo hacer una puesta al día sobre las características del H. pylori, los mecanismos patogénicos, genes de virulencia, su asociación con el mayor riesgo de cáncer gástrico, farmacorresistencia microbiana y su erradicación.

Helicobacter pylori is recognized as a class I carcinogen resistant to multiple antibiotics and with high priority in public health. The infection caused by this microorganism is influenced by a complex interaction between host genetics, environment, and multiple virulence factors of the infecting strain. It affects 50% of the world population, causing severe gastroduodenal conditions, most of them asymptomatic. Through time, 20% of individuals with H. pylori may develop preneoplastic gastric lesions and 2% of them develop gastric cancer. The gastrointestinal and extra-gastrointestinal clinical manifestations are associated with its virulence and the response of the immune system with the release of pro-inflammatory cytokines, such as TNF-alpha, IL-6, IL-10 and IL-8, which cause acute and chronic inflammation. Multiple virulence factors have been studied, such as cytotoxin-associated gene A (CagA) and vacuolating cytotoxin A (VacA), which play an important role in the development of gastric cancer. Due to the increasing antibiotics resistance, the research in the immediate future should be aimed at establishing the usefulness of the new antibiotics and the determination of Colombian prophages throughout the country. This paper aims to update the characteristics of H. pylori, its pathogenic mechanisms, virulence genes, its association with the increased risk of gastric cancer, microbial drug resistance, and eradication.

Helicobacter pylorié um carcinógeno tipo I resistente a múltiplos antibióticos e com alta prioridade na saúde pública. A infecção por este microrganismo está influenciada por uma interação complexa entre a genética do hospede, o entorno e múltiplos fatores de virulência da cepa infectante. Afeta a 50% da população mundial, provocando afeções gastroduodenais graves, a maioria de forma assintomática. 20% dos indivíduos com H. pylori podem desenvolver através do tempo lesões gástricas pré-neoplásicas e 2% deles um câncer gástrico. As manifestações clínicas gastrointestinais e extragastrointestinais estão associadas à sua virulência e à resposta do sistema imunológico com a liberação de citocinas pró-inflamatórias, tais como TNF-alfa, IL-6, IL-10 e IL-8, causantes de inflamação aguda e crónica. Múltiplos fatores de virulência hão sido estudados como o gene. A associado à citotoxina (CagA) e a citotoxina vacuolante (VacA), os quais jogam um papel importante no aparecimento do câncer gástrico. Dada a resistência cada vez maior aos antibióticos utilizados, as linhas de estudo no futuro imediato devem estar encaminhadas em estabelecer a utilidade dos novos antibióticos e a determinaçãode profagos colombianos em todo o país. Esta revisão tem como objetivo fazer uma atualização sobre as características do H. pylori, os mecanismos patogénicos, genes de virulência, sua associação com o maior risco de câncer gástrico, farmacorresistência microbiana e sua erradicação.

Phospholipase and proteinase activities of isolates of colonizing Candida spp. causing vulvovaginitis in pregnant women / Actividad de fosfolipasas y proteasas en aislamientos de especies de Candida colonizadoras y causantes de vulvovaginitis en mujeres gestantes

Introduction: Proteases and phospholipases are virulence factors of Candida spp. that play an important role in tissue invasion. Among the factors related to the host some are associated with environmental characteristics and others with Candida colonization. Objectives: To determine phospholipase and protease activities in colonizing and pathogenic strains, isolated from pregnant women in Cartagena de Indias. Materials and methods: Phospholipase and protease activity was determined in 56 isolates, evaluating substrate degradation and calculating the enzyme activity coefficient. Phospholipase and protease activities were compared between colonizing and pathogenic strains. Results: "Very high" (<0.69) phospholipase and protease activity was found in 34 and 14 isolates, respectively. There was no significant difference when comparing phospholipase and protease activities between colonizing and pathogenic isolates. Conclusions: Phospholipase activity predominated as a virulence factor in the studied strains, but no significant difference found between colonizing and pathogenic strains for phospholipase and protease activities.

Introducción: Las proteasas y las fosfolipasas son factores de virulencia de Candida spp. que cumplen un papel importante en la invasión de los tejidos. Entre los factores relacionados con el huésped, se encuentran algunos asociados con las características ambientales y otros con la colonización. Objetivo: Determinar la actividad de fosfolipasas y proteasas en aislamientos de especies colonizadoras y patógenas de Candida spp., aisladas de mujeres gestantes de Cartagena de Indias. Materiales y métodos. Se determinó la actividad de fosfolipasas y proteasas en 56 aislamientos mediante degradación del sustrato y cálculo del coeficiente de actividad enzimática. Se compararon las actividades de fosfolipasas y proteasas, entre los aislamientos colonizadores y los patógenos. Resultados: La actividad de la fosfolipasa fue "muy alta" (< 0,69) en 34 aislamientos e, igualmente, la de la proteasa en 14. No hubo diferencias significativas al comparar las actividades de las fosfolipasas y de las de las proteasas, entre los aislamientos colonizadores y los patógenos. Conclusiones: La actividad de las fosfolipasas predominó como factor de virulencia en los aislamientos estudiados. No obstante, no se encontró una diferencia significativa entre los grupos de aislamientos colonizadores y los patógenos, en cuanto a las actividades de fosfolipasas y proteasas.

Frecuencia de genes que codifican proteínas autotransportadoras serin-proteasa de Enterobacteriaceae (SPATE) en cepas de Escherichia coli difusamente adherente (DAEC) provenientes de niños con y sin diarrea / Frequency of serine protease autotransporters of enterobacteriaceae (SPATE) encoding genes in diffusely adherent escherichia coli (DAEC) isolates from children with and without diarrhea

RESUMEN El objetivo del estudio fue determinar la frecuencia de seis genes que codifican proteínas autotransportadoras serin-proteasa de Enterobacteriaceae (SPATE) en aislamientos de Escherichia coli difusamente adherente (DAEC) provenientes de niños con diarrea (NCD, n=63) y sin diarrea (NSD, n=41) de Lima, Perú. Los NSD se consideraron como grupo control. Para la detección de los genes se estandarizaron 2 PCRs múltiples: triple A (sigA, pet, espP) y triple B (sat, pic, espC). En ambos grupos el gen SPATE más frecuente fue sat (39,7% de NCD y 41,5% de NSD), seguido de espP (20,6% y 9,7% en NCD y NSD respectivamente). Los otros genes se detectaron en proporciones inferiores al 10,0%, en el siguiente orden de frecuencia: pet, sigA, espC y pic, sin diferencias significativas entre los grupos. Se concluye que Sat es la SPATE más frecuente en cepas DAEC, y que estas cepas pueden poseer genes SPATE independientemente de si se aíslan en NCD o NSD.

ABSTRACT The aim of the study was to determine the frequency of six genes encoding serine protease autotransporter proteins Enterobacteriaceae (SPATE) in diffusely adherent Escherichia coli (DAEC) isolates from children with (WD, n=63) and without diarrhea (WOD, n=41) from Lima, Peru. WOD were considered a control group. For the detection of the genes, 2 multiple PCRs were standardized: triple A (sigA, pet, espP) and triple B (sat, pic, espC). In both groups, the most frequent SPATE gene was Sat (39.7% of WD and 41.5% of WOD), followed by spP (20.6% and 9.7% in WD and WOD respectively). The other genes were detected in proportions lower than 10.0%, in the following order of frequency: pet, sigA, espC and pic, without significant differences between the groups. It was concluded that Sat is the most frequent SPATE in DAEC and that these strains may possess SPATE genes regardless of whether they are isolated in WD or WOD.

Frecuencia de genes que codifican proteínas autotransportadoras serin-proteasa de Enterobacteriaceae (SPATE) en cepas de Escherichia coli difusamente adherente (DAEC) provenientes de niños con y sin diarrea / Frequency of serine protease autotransporters of enterobacteriaceae (SPATE) encoding genes in diffusely adherent escherichia coli (DAEC) isolates from children with and without diarrhea

RESUMEN El objetivo del estudio fue determinar la frecuencia de seis genes que codifican proteínas autotransportadoras serin-proteasa de Enterobacteriaceae (SPATE) en aislamientos de Escherichia coli difusamente adherente (DAEC) provenientes de niños con diarrea (NCD, n=63) y sin diarrea (NSD, n=41) de Lima, Perú. Los NSD se consideraron como grupo control. Para la detección de los genes se estandarizaron 2 PCRs múltiples: triple A (sigA, pet, espP) y triple B (sat, pic, espC). En ambos grupos el gen SPATE más frecuente fue sat (39,7% de NCD y 41,5% de NSD), seguido de espP (20,6% y 9,7% en NCD y NSD respectivamente). Los otros genes se detectaron en proporciones inferiores al 10,0%, en el siguiente orden de frecuencia: pet, sigA, espC y pic, sin diferencias significativas entre los grupos. Se concluye que Sat es la SPATE más frecuente en cepas DAEC, y que estas cepas pueden poseer genes SPATE independientemente de si se aíslan en NCD o NSD.

ABSTRACT The aim of the study was to determine the frequency of six genes encoding serine protease autotransporter proteins Enterobacteriaceae (SPATE) in diffusely adherent Escherichia coli (DAEC) isolates from children with (WD, n=63) and without diarrhea (WOD, n=41) from Lima, Peru. WOD were considered a control group. For the detection of the genes, 2 multiple PCRs were standardized: triple A (sigA, pet, espP) and triple B (sat, pic, espC). In both groups, the most frequent SPATE gene was Sat (39.7% of WD and 41.5% of WOD), followed by spP (20.6% and 9.7% in WD and WOD respectively). The other genes were detected in proportions lower than 10.0%, in the following order of frequency: pet, sigA, espC and pic, without significant differences between the groups. It was concluded that Sat is the most frequent SPATE in DAEC and that these strains may possess SPATE genes regardless of whether they are isolated in WD or WOD.

Detección de Patotipos de Cepas de Escherichia coli Causantes de Diarrea Infantil de Establecimientos de Salud de la Región Lambayeque-Perú, 2018 / Detection of Patotypes of Escherichia coli Strains Causing Childhood Diarrhea in Health Establishments of the Lambayeque-Peru Region, 2018

Objetivo: Identificar patotipos de genes de virulencia de Escherichia coli de muestras diarreicas de niños menores de cinco años de la Región Lambayeque, en el periodo abril­setiembre 2018. El estudio: Estudio descriptivo y transversal. Se analizaron 75 cepas de E. coli de muestras diarreogénicas usando PCR Multiplex en tiempo real y primers para genes de patotipos de E. coli: daaD, aggR, eaeA, stx, ipaH y st. Hallazgos: Se detectó 34,66 % (26/75) de genes de virulencia del total de cepas aisladas. El patotipo de E. coli Enterotoxigénica presentó mayor frecuencia, 18,67% (14/75) del total de cepas aisladas. También se detectó que el patotipo E. coli Enterotoxigénica se presentó en 53,86% (14/26) del total de cepas positivas. También en un 11,54% de cepas positivas (3/26) presentaron más de un patotipo. Conclusión: La epidemiologia molecular ayudará a un mejor diagnóstico adecuado y oportuno de las diarreas infantiles en esta población vulnerable.

Objetive. To identify pathotypes of virulence genes of Escherichia coli from diarrheal samples of children under five years of age in the Lambayeque Region, in the period April-September 2018. The study: Descriptive and cross-sectional study. 75 E. coli strains from diarrheogenic samples were analyzed using realtime Multiplex PCR and primers for E. coli pathotype genes: daaD, aggR, eaeA, stx, ipaH and st. Findings: 34.66% (26/75) of virulence genes were detected from the total isolates. The enterotoxigenic E. coli pathotype presented the highest frequency, 18.67% (14/75) of the total isolates. It was also detected that the enterotoxigenic E. coli pathotype appeared in 53.86% (14/26) of the total positive strains. Also, in 11.54% of positive strains (3/26) they presented more than one pathotype. Conclusion: Molecular epidemiology will help a better, adequate and timely diagnosis of childhood diarrhea in this vulnerable population

Prevalence, antifungal susceptibility and virulence determinants of oral yeast species isolated from immunodeficient patients in Northeastern Brazil / Prevalência, suscetibilidade a antifúngicos e determinantes de virulência de leveduras orais isoladas de pacientes imunodeficientes do Nordeste do Brasil / Prevalencia, susceptibilidad antifúngica y determinantes de virulencia de levaduras orales aisladas de pacientes inmunodeficientes del Noreste de Brasil

Justificativa e Objetivos: A candidíase oral tem uma ocorrência comum em pacientes imunocomprometidos. No entanto, outras infecções emergentes tornaram-se cada vez mais habituais. O objetivo deste estudo foi investigar a prevalência, os determinantes de virulência e a suscetibilidade a antifúngicos de leveduras que colonizam a mucosa de pacientes imunocomprometidos na região Nordeste do Brasil. Métodos: A amostra foi composta por 60 pacientes HIV positivos atendidos no Serviço de Atendimento Especializado/Hospital Dia do Hospital Universitário Prof. Alberto Antunes, vinculado à Universidade Federal de Alagoas. As amostras foram coletadas em regiões subgengivais e semeadas em CHROMagar para confirmação presuntiva de Candida spp., seguido por PCR e sequenciamento. Além disso, testamos os determinantes de virulência fosfolipase e protease e avaliamos in vitro a concentração inibitória mínima dos antifúngicos anfotericina B e fluconazol. Este projeto foi aprovado pelo Comitê de ética em pesquisa do Centro de Estudos Superiores de Maceió. Resultados: Aproximadamente 63% dos pacientes foram colonizados por leveduras. A espécie C. albicans foi predominante, enquanto as espécies de Candida não-albicans representaram 49% dos isolados, sendo C. dubliniensis e C. parapsilosis as mais comuns. Entretanto, C. intermedia, Bullera penniseticola e Naganishia liquefaciens também foram encontrados. Os determinantes da virulência protease e/ou fosfolipase também foram produzidos por Candida spp. e alguns isolados oportunistas incomuns como Kodamaea ohmeri, N. liquefaciens e Saitozyma podzolica. Além disso, a maioria dos isolados de Candida spp. e algumas espécies oportunistas incomuns apresentaram altos valores de concentração inibitória mínima. Conclusão: Os resultados obtidos indicam que C. albicans continua a ser a espécie predominante na cavidade oral de pacientes imunodeficientes e, juntamente com outras espécies incomuns, pode apresentar alta resistência aos antifúngicos testados.(AU)

Background and Objectives: Oral candidiasis has a common occurrence in immunocompromised patients. However, other emergent infections have become increasingly common. The aim of this study was to investigate the prevalence, virulence determinants and the antifungal susceptibility of yeast colonizing the mucosa of immunocompromised patients in Northeastern Brazil. Methods: Samples from sixty HIV-positive patients seen at the Specialized Service / Hospital Dia - Hospital Universitário Prof. Alberto Antunes from the Federal University of Alagoas were collected from subgingival sites and seeded on CHROMagar for presumptive confirmation of Candida spp. followed by PCR and sequencing. In addition, we tested virulence determinants, phospholipase and protease and evaluated in vitro the Minimum Inhibitory Concentration of antifungals amphotericin B and fluconazole. This project was approved by the Research Ethics Committee of the Center for Higher Studies in Maceió. Results: Approximately 63% of the patients were colonized by yeasts, with C. albicans as the predominant species, while non-Candida albicans species accounted for 49% of the isolates, with C. dubliniensis and C. parapsilosis being the commonest, but C. intermedia, Bullera penniseticola and Naganishia liquefaciens were also found. The virulence determinants protease and/or phospholipase were also produced by Candida spp. and some uncommon opportunistic isolates such as Kodamaea ohmeri, N. liquefaciens and Saitozyma podzolica. Furthermore, most of Candida spp. strains and some uncommon opportunistic species showed high values of minimal inhibitory concentration. Conclusion: Results obtained indicate that C. albicans continues to be the predominant species in oral cavity of immunodeficient patients and along with other unusual species may present high resistance to the antifungals tested.(AU)

Justificación y Objetivos: La candidiasis oral acomete con frecuencia a pacientes inmunocomprometidos. Sin embargo, otras infecciones emergentes se han vuelto cada vez más comunes. El objetivo de este estudio fue investigar la prevalencia, la producción de determinantes de virulencia y la susceptibilidad a antifúngicos de levaduras que colonizan la mucosa de pacientes inmunocomprometidos en la región Nordeste de Brasil. Métodos: Se colectaron muestras de sesenta pacientes VIH positivos atendidos en el Servicio de Atención Especializado/Hospital Día del Hospital Universitario Prof. Alberto Antunes, vinculado a la Universidad Federal de Alagoas. Se colectaron las muestras en las regiones subgingivales y las sembraron en CHROMagar para la presunta confirmación de Candida spp. seguido de PCR y secuenciación. Además, analizamos los determinantes de virulencia fosfolipasa y proteasa y evaluamos in vitro la concentración mínima inhibitoria de los antifúngicos anfotericina B y fluconazol. Este proyecto fue aprobado por el Comité de Ética en Investigación del Centro de Estudios Superiores de Maceió. Resultados: Aproximadamente el 63% de los pacientes fueron colonizados por levaduras, y la C. albicans fue la especie predominante, mientras que las especies de Candida no-albicans representaron el 49% de los aislamientos, de las cuales la C. dubliniensis y la C. parapsilosis fueron las más comunes. Sin embargo, también se encontraron C. intermedia, Bullera penniseticola y Naganishia liquefaciens. Los determinantes de virulencia de proteasa y/o fosfolipasa también fueron producidos por Candida spp. y algunos aislados oportunistas inusuales como Kodamaea ohmeri, N. liquefaciens y Saitozyma podzolica. Además, la mayoría de los asilados de Candida spp. y algunas especies oportunistas inusuales mostraron valores altos de concentración mínima inhibitoria. Conclusión: Los resultados obtenidos indican que C. albicans continúa siendo la especie predominante en la cavidad oral de pacientes inmunodeprimidos y, junto con otras especies poco comunes, puede presentar una alta resistencia a los antifúngicos evaluados.(AU)

Genes y determinantes de virulencia de Mycobacterium tuberculosis que contribuyen a la evasión de la respuesta inmune / Mycobacterium tuberculosis genes and virulence determinants that contribute to the immune response evasion

La tuberculosis pulmonar es un problema de salud pública a nivel mundial. La Organización Mundial de la Salud en el año 2018 reportó alrededor de 10 millones de enfermos y 1,5 millones de muertes. Mycobacterium tuberculosis es un patógeno intracelular y el agente causal de la enfermedad. Estudios experimentales de virulencia han permitido determinar un conjunto de genes de virulencia, que le confieren la capacidad de resistir el ambiente hostil en el macrófago, superar la actividad de la respuesta inmune y persistir en el hospedero. El objetivo de la publicación es presentar una revisión de las investigaciones de los últimos 20 años que han demostrado los genes o factores de virulencia de M. tuberculosis que contribuyen a la evasión de la respuesta inmune. Según los resultados de las investigaciones, existen múltiples factores y genes de virulencia que participan en la evasión de la respuesta inmune innata como ESAT-6, PknG, PhoP, ManLAM, SapM, katG, tpx, nuoG, sodA/secA2, pknE y Rv3654c/Rv3655c, mientras existen elementos capaces de modular la respuesta inmune adaptativa. La comprensión de la interacción entre los genes de virulencia y la actividad del sistema inmune, son importantes para estudiar nuevos métodos de diagnóstico, el diseño de nuevas vacunas y por ende, mejorar las medidas de control, prevención y tratamiento de la tuberculosis(AU)

Pulmonary tuberculosis is a public health problem worldwide. The World Health Organization in 2018 reported about 10 million patients and 1.5 million deaths. Mycobacterium tuberculosis, an intracellular pathogen, is the causative agent of the disease. Experimental virulence studies have allowed to determine a set of virulence genes that confer the ability to resist the hostile environment in the macrophage, overcome the activity of the immune response and persist in the host. The objective of the publication is to present a review of the last 20 years investigations that have shown the genes or virulence factors of M. tuberculosis that contribute to the evasion of the immune response. According to the results of the investigations, there are multiple virulence factors and genes that participate in the evasion of the innate immune response such as ESAT-6, PknG, PhoP, ManLAM, SapM, katG, tpx, nuoG, sodA/secA2, pknE and Rv3654c/Rv3655c, while there are elements capable of modulating the adaptive immune response. The understanding of the interaction between the virulence genes and the activity of the immune system, are important to study new diagnostic methods, the design of new vaccines and therefore, to improve the control, prevention and treatment measures of tuberculosis(AU)

Respuesta inmunológica y bioquímica de ancianos con infección urinaria frente factores de virulencia en Escherichia coli uropatógenas / Immunological and biochemical response of older adults with urinary tract infection to uropathogenic Esherichia coli virulence factors

RESUMEN Con el objetivo de evidenciar diferencias en la respuesta inmunológica y bioquímica de ancianos con infección del tracto urinario (ITU) por Escherichia coli (E. coli) frente a factores de virulencia de importancia en la patogenia de la ITU, se realizó un estudio descriptivo en el cual se evaluaron 24 muestras de orina de adultos mayores con ITU provenientes de centros de reposo gerontológicos. Se determinó la concentración de hierro, TNF-α, IL-1β y la capacidad antioxidante en la orina, encontrándose una relación entre una mayor concentración de hierro y de hematíes en la orina con la presencia del gen pap GII en la E. coli. Se concluye que los adultos mayores con ITU por E. coli portadoras del gen pap GII, presentan mayor daño tisular.

ABSTRACT Descriptive study in which 24 urine samples from older adults with urinary tract infection (UTI), from nursing homes, were evaluated; in order to identify differences in the immune and biochemical response from older adults with UTI by Escherichia coli (E. coli) to major virulence factors in the pathogenesis of UTI. Iron concentration, TNF-α, IL-1β and antioxidant capacity in urine were determined. A relation was found between, an increase in iron and red blood cell concentration in urine, and the presence of the pap GII gene found in E. coli. It is concluded that older adults, with UTIs by E. coli with the gene pap GII, have increased tissue damage.

Presencia de genes fimH y afa en aislamientos urinarios de Escherichia coli productora de betalactamasas de espectro extendido en Lima, Perú / Presence of fimH and afa genes in urinary isolates of extended-spectrum beta-lactamases producing Escherichia coli in Lima, Peru

RESUMEN Con el objetivo de determinar la presencia de los genes fimH y afa en aislamientos urinarios de Escherichia coli productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE), se realizó un estudio descriptivo, con aislamientos del cepario del proyecto TO-06/09 del Instituto Nacional de Salud del Niño en Lima, Perú. Se incluyeron 75 aislamientos urinarios de Escherichia coli. La identificación de genes se realizó por reacción en cadena de la polimerasa. De los 75 aislamientos, 74 (98,7%) fueron positivos para el gen fimH y 6 (8,0%) fueron positivos para el gen afa. Se evidenció la presencia de los factores de virulencia producidos por los genes fimH y afa en aislamientos urinarios de Escherichia coli productoras de BLEE.

ABSTRACT Descriptive study conducted in order to determine the presence of the fimH and afa genes in urinary isolates of extended-spectrum beta-lactamases (ESBL) producing Escherichia coli. Isolates from project TO-06/09 of the Instituto Nacional de Salud del Niño in Lima, Peru were used. A total of 75 urinary isolates of Escherichia coli were included. Gene identification was performed by polymerase chain reaction. From the 75 isolates, 74 (98.7%) were positive for the fimH gene and 6 (8.0%) were positive for the afa gene. Virulence factors produced by the fimH and afa genes were evident in urinary isolates of ESBL producing Escherichia coli.

[Genetic characterization of rice endophytic bacteria (Oryza sativa L.) with antimicrobial activity against Burkholderia glumae]. / Caracterización genética de bacterias endofíticas de arroz (Oryza sativa L.) con actividad antimicrobiana contra Burkholderia glumae.

The aim of the present study was to isolate, select and characterize endophytic bacteria in rice inhibiting Burkholderia glumae THT as well as to characterize the genetic diversity and virulence factors in strains of B. glumae and Burkholderia gladioli of rice. Rice plants were collected in 4 departments from the northern region of Peru, isolating endophytic bacteria, after tissue sterilization, at 30°C (48h) in Trypticase Soy Agar (TSA), evaluating the antimicrobial activity against B. glumae THT, production of siderophores, resistance of toxoflavine and partial sequencing of the 16S rRNA gene. Furthermore, B. glumae and B. gladioli were isolated in selective medium (pH 4.5) at 41°C/72h. Molecular identification was performed using BOX-PCR and sequencing of the 16S rRNA gene, in addition to the production of extracellular enzymes, motility tests and sensitivity/resistance to bactericides. One hundred and eighty nine (189) endophytic bacteria were isolated, and only 9 strains showed antimicrobial activity against B. glumae THT, highlighting Burkholderia vietnamiensis TUR04-01, B. vietnamiensis TUR04-03 and Bacillus aryabhattai AMH12-02. The strains produced siderophores and at least 55.5% were resistant to toxoflavin. Additionally, 17 strains were grouped into 9 BOX-PCR profiles, where 16 had similarity with B. glumae LMG2196T (100%) and 1 with B. gladioli NBRC 13700T (99.86%). High diversity was found according to geographical origin and virulence factors. In conclusion, strains of the genus Bacillus and Burkholderia are potential biocontrol agents against B. glumae.

Microbiology of Hafnia alvei. / Microbiología de Hafnia alvei.

Hafnia alvei is a Gram-negative facultatively anaerobic bacillus that constitutes part of the human gut flora. Until recently, H. alvei strains could be mistakenly identified by conventional methods, miniaturisation or automatic systems as members of the Serratia, Escherichia, Citrobacter, Yokenella, Obesumbacterium or Salmonella genera. Consequently, molecular techniques were required for their definitive identification in the clinical laboratory. In addition, a new Hafnia species, H. paralvei, has recently appeared, which undoubtedly includes many of the strains reported in the literature as H. alvei. Alrhough H. alvei isolation from human clinical specimens remains uncommon, the development of drug resistance due to this species is emerging and it is likely that this organism will gain increasing importance in the future. Moreover, although H. alvei shares some virulence mechanisms with other Gram-negative enteropathogens, little is known about the factors that contribute to its pathogenesis in humans. The present article reviews the current identification methods, antimicrobial resistance and virulence factors of this bacterium.

Prevalencia de cepas del grupo de Bacillus cereus productoras de biopelicula en helados comercializados en México / Prevalence of strains of the Bacillus cereus group biofilm producers in ice cream in Mexico

El helado es un vehículo para la transmisión de patógenos como Bacillus cereus. Por lo cual, se determinó la frecuencia de cepas del grupo Bacillus cereus en helados, perfil enterotoxigénico, psicrofilia y producción de biopelícula. Un total de 230 muestras de seis marcas de helado de producción y distribución nacional fueron colectadas en México. El análisis microbiológico incluyó aislamiento en agar manitol yema de huevo. Las cepas se identificaron molecularmente a partir de la amplificación del gen de la topoisomerasa (gyrB) y el perfil enterotoxigénico por la amplificación de regiones conservadas de los operones nheABC y hblABD y del gen cytK. Además, se determinó la producción de biopelícula en vidrio y policloruro de vinilo. La frecuencia de contaminación por cepas del grupo B. cereus fue de 3,6%, se encontró una cepa positiva para nheABC y cinco para cytK, el 87,5% de las cepas generó biopelícula en vidrio y todas en policloruro de vinilo, dos cepas fueron psicrofilicas. En conclusión, en el helado distribuido en México, se encontró una baja contaminación por cepas del grupo B. cereus con alta producción de biopelícula; sin embargo, no se debe subestimar el potencial enterotoxigénico de estas cepas

Ice cream is a medium for microbial growth due to its nutritional value and neutral pH. Therefore, the frequency of strains of the Bacillus cereus group in ice cream was determined, the enterotoxigenic profile, psychrophilic strains and biofilm production. A total of 230 samples of six brands of ice cream produced and distributed nationwide were collected in Mexico. The microbiological analysis was a cold pre-enrichment and isolation of the microorganism in egg yolk agar. The strains were identified molecularly from the amplification of the topoisomerase gene (gyrB) and the enterotoxigenic profile by the amplification of conserved regions of the nheABC and hblABD operons and of the cytK gene. In addition, the production of biofilm in glass and polyvinyl chloride and psychophilia was determined. The frequency of contamination by strains of the B. cereus group was 3.6%, a positive strain was found for nheABC and five for cytK, 87.5% of the strains generated biofilm in glass and all in polyvinyl chloride, two strains were psychrophilic. In the ice cream distributed in Mexico, a low contamination by strain of the B. cereus group was found, however, the enterotoxigenic potential of the strains should not be underestimated